Zúčtování odloženého příjmu přináší v JMHZ nové administrativní povinnosti. Je třeba správně dohledat identifikátor pracovněprávního vztahu, případně zaměstnance zpětně registrovat a dodržet specifická pravidla pro vykazování odloženého příjmu podle případné účasti na nemocenském pojištění.